Detekce salmonel v potravinách pomocí genových sond

Infekce salmonel nebo ohniska salmonel jsou často způsobeny kontaminovanou potravou. Proto je vyšetření potravin na salmonelu jedním z nejdůležitějších preventivních opatření k zabránění lidské salmonelózy.

„Zlatý standard“ pro detekci salmonel v potravinách, který je založen na konvenční kulturní metodice, je časově velmi náročný a náročný na práci. Dosažení výsledků trvá 3 až 5 pracovních dnů. Existuje proto velký zájem na vývoji rychlých, citlivých a specifických detekčních metod. V předchozích studiích byla popsána technika, při které byla 23S ribosomová podjednotka Salmonella v tkáních detekována pomocí fluorescenčně značených genových sond in situ hybridizací.

FANG a kol. zkontrolováno, do jaké míry je tato metoda FISH (fluorescenční in situ hybridizace) vhodná pro detekci Salmonella v potravinách (Q. FANG, S. BROCKMANN, K. BOTZENHART, A. WIEDEMANN: Vylepšená detekce Salmonella spp. v potravinách fluorescenční hybridizace situ s 23S rRNA sondami: srovnání s konvenčními kultivačními metodami).

Pro jejich výzkum autoři použili tři oligonukleotidové sondy (Sal-1, Sal-3, Sal-544), které byly druhově specifické pro 23S rRNA Salmonella. Těmito sondami bylo testováno celkem 51 kmenů Salmonella různých serovarietas a 46 kmenů jiných druhů Enterobacteriaceae a druhů jiných čeledí. Všechny kmeny Salmonella hybridizovaly se sondami; nebyly nalezeny žádné zkřížené reakce s ostatními izoláty, které nepatří k druhu Salmonella. Dále bylo zkoumáno, zda rozdílné skladování testovacích kmenů před provedením metody FISH může ovlivnit výsledky. Nebyl pozorován žádný vliv podmínek skladování testovaných kmenů na účinnost.

Vyšetření 18 různých druhů potravin ukázalo, že různé matrice také neovlivnily výsledky testu. Pomocí metody FISH byla Salmonella detekována u 52 (sonda Sal-1), 56 (sonda Sal-3) a u 36 z 225 nativních vzorků. Za použití standardních konvenčních kulturních metod byla Salmonella izolována pouze z 30 z 225 vzorků.

Zdroj: Pichner [PICHNER]