Расшыфраваны геном Lactobacillus johnsonii
Страўнікава-кішачны тракт чалавека (ЖСТ) - гэта багатае пажыўнымі рэчывамі асяроддзе, каланізаванае вялікім і складаным наборам мікраарганізмаў. Мікраарганізмы гуляюць важную ролю ў функцыянаванні і развіцці кішачніка. Склад мікрафлоры змяняецца індывідуальна, у залежнасці ад узросту і ад аддзела кішачніка да аддзела кішачніка. Ён змяшчае больш за 500 відаў бактэрый. Бактэрыі ўдзельнічаюць у пераварванні поліцукрыдаў і бялкоў і адказваюць за вялікую частку метабалізму MDT. Яны таксама вырабляюць вітаміны, тоўстыя кіслоты з кароткай ланцугом і іншыя пажыўныя рэчывы для свайго гаспадара.
Збалансаваная і разнастайная мікрафлора мае важнае значэнне для здаровай працы кішачніка і абароны ад кішачных патагенаў. Такім чынам, некаторыя віды Lactobacillus, некаторыя біфідабактэрыі і прадукты, ферментаваныя імі, шырока прадаюцца як прабіётычныя прадукты. На долю групы Lactobacillus-Enterococcus прыпадае 6% складу мікрафлоры кала і 23% мікрафлоры сляпой кішкі на пераходзе паміж тонкім і тоўстым кішачнікам. З больш чым 50 вядомых відаў Lactobacillus «ацыдафільны комплекс», які складаецца з 6 блізкіх відаў, атрымаў асаблівую ўвагу, таму што гэтыя мікраарганізмы, як кажуць, валодаюць прабіётычнымі ўласцівасцямі і рэгулярна вылучаюцца з калавых мас і слізістых абалонак чалавека.
L. johnsonii NCC533 (раней L. acidophilus La1) у апошнія гады інтэнсіўна вывучаецца на прадмет яго прабіётычнай актыўнасці (імунная мадуляцыя, інгібіраванне патагенаў, прымацаванне да эпітэліяльных клетак). Зараз геном гэтай бактэрыі цалкам секвеніраваны даследчай групай са Швейцарыі (Даследчы цэнтр Nestlé) і ЗША (Універсітэт штата Паўночная Караліна, Ролі і Універсітэт Джорджыі, Афіны).
Геном змяшчае 1.992.676 533 12 пар асноў. Звяртае на сябе ўвагу адсутнасць генаў сінтэзу амінакіслот, пурынавых нуклеатыдаў і большасці кофакторы (тыяміну, нікацінавай кіслаты, рыбафлавіну, біятыну, кобаламина, пантатэнавай кіслаты, підрыдаксін). У якасці кампенсацыі знойдзена значная колькасць незвычайных і часта дубляваных пермеаз амінакіслот, пептыдаз і транспарцёраў тыпу фасфатрансферазы, што сведчыць аб моцнай залежнасці L. johnsonii NCCXNUMX ад яго гаспадара або іншых кішачных арганізмаў. Паслядоўнасць геному таксама прадказвае XNUMX вялікіх і незвычайных паверхневых бялкоў, якія могуць быць важнымі для прымацавання да эпітэліяльных клетак кішачніка.
Таксама былі выяўлены тры гідралазы жоўцевых соляў (BSH) і два транспарцёры жоўцевых кіслот, якія, як мяркуюць, важныя для выжывання пры MDT. Мяркуецца, што BSH спрыяюць уключэнню халестэрыну або жоўці ў бактэрыяльную мембрану, змяняючы цякучасць або зарад, каб уплываць на адчувальнасць да α-дефензинам і іншым малекулам абароны гаспадара. Гены для сінтэзу de novo пиримидинов dTMP, UMP і CMP прысутнічаюць, але не для біясінтэзу пуринов. Існуюць гены для пераўтварэння инозина, ксантина і гипоксантина ў IMP, GMP і AMP. Такім чынам, L. johnsonii NCC533 з'яўляецца аўксатрофным для многіх будаўнічых блокаў у адпаведнасці з патрабаваннямі да харчавання. Поўная залежнасць ад экзагенных амінакіслот суправаджаецца незвычайна вялікай колькасцю і разнастайнасцю протеиназ, пераносчыкаў пептыдаў і пептыдаз (> 25 цытаплазматычных пептыдаз).
У цэлым L. johnsonii NCC533, здаецца, лепш прыстасаваны да навакольнага асяроддзя верхняга MDT у параўнанні з Bifidobacteria, Bacteroides і іншымі бактэрыямі тоўстай кішкі. Аднак яшчэ трэба вызначыць, ці з'яўляецца L. johnsonii «абавязковым» каменсалам MDT або мае іншыя рэзервуары. Геном L. johnsonii шмат у чым ідэнтычны геному яго бліжэйшага сваяка L. gasseri. Гены асноўнага абмену дэманструюць ідэнтычнасць паслядоўнасці >94%. Поўная паслядоўнасць геному забяспечвае аснову для лепшага разумення камменсальных узаемадзеянняў з гаспадаром «чалавекам».
Крыніца: Kulmbach [KRÖCKEL]
