لیکٹو بیکیلس جانسونی جینوم کو ڈی کوڈ کیا گیا۔
انسانی معدے کی نالی (MDT) ایک غذائیت سے بھرپور ماحول ہے جو مائکروجنزموں کے ایک بڑے اور پیچیدہ مجموعہ کے ذریعے نوآبادیاتی ہے۔ مائکروجنزم آنت کے کام اور نشوونما میں اہم کردار ادا کرتے ہیں۔ مائکرو فلورا کی ساخت انفرادی طور پر مختلف ہوتی ہے، عمر کے لحاظ سے اور آنتوں کے حصے سے آنتوں کے حصے تک۔ اس میں 500 سے زیادہ اقسام کے بیکٹیریا ہوتے ہیں۔ بیکٹیریا پولی سیکرائڈز اور پروٹین کے عمل انہضام میں شامل ہیں اور MDT میٹابولزم کے ایک بڑے حصے کے لیے ذمہ دار ہیں۔ وہ اپنے میزبان کے لیے وٹامنز، شارٹ چین فیٹی ایسڈ اور دیگر غذائی اجزاء بھی تیار کرتے ہیں۔
ایک متوازن اور متنوع مائکرو فلورا صحت مند آنتوں کے کام اور آنتوں کے پیتھوجینز کے خلاف دفاع کے لیے ضروری ہے۔ لہذا، کئی لییکٹوباسیلس پرجاتیوں، کچھ بائفیڈوبیکٹیریا اور ان کے ذریعہ خمیر شدہ کھانے کی اشیاء کو پروبائیوٹک فوڈز کے طور پر بڑے پیمانے پر فروخت کیا جاتا ہے۔ Lactobacillus-Enterococcus گروپ چھوٹی اور بڑی آنتوں کے درمیان سنگم پر فیکل مائکرو فلورا کی ساخت کا 6% اور سیکم کے مائکرو فلورا کا 23% بناتا ہے۔ 50 سے زیادہ معلوم Lactobacillus پرجاتیوں میں سے، 'acidophilus کمپلیکس'، جو 6 قریبی متعلقہ انواع پر مشتمل ہے، کو خاص توجہ حاصل ہوئی کیونکہ کہا جاتا ہے کہ ان مائکروجنزموں میں پروبائیوٹک خصوصیات ہیں اور وہ انسانی پاخانے اور چپچپا جھلیوں سے باقاعدگی سے الگ تھلگ رہتے ہیں۔
L. johnsonii NCC533 (سابقہ L. acidophilus La1) کا حالیہ برسوں میں اس کی پروبائیوٹک سرگرمیوں (مدافعتی ماڈیولیشن، پیتھوجینز کی روک تھام، اپکلا خلیات سے لگاؤ) کے لیے گہرائی سے مطالعہ کیا گیا ہے۔ اس جراثیم کے جینوم کو اب سوئٹزرلینڈ (Nestlé Research Center) اور USA (North Carolina State University, Raleigh and University of Georgia, Athens) کے ایک تحقیقی گروپ نے مکمل طور پر ترتیب دیا ہے۔
جینوم میں 1.992.676 بیس جوڑے ہوتے ہیں۔ جو چیز حیران کن ہے وہ امینو ایسڈز، پیورین نیوکلیوٹائڈس اور زیادہ تر کوفیکٹرز (تھیامین، نیکوٹینک ایسڈ، رائبوفلاوین، بایوٹین، کوبالامین، پینٹوتھینک ایسڈ، پائیڈروکسین) کی ترکیب کے لیے جین کی عدم موجودگی ہے۔ معاوضے میں، غیر معمولی اور اکثر نقل شدہ امینو ایسڈ پرمیز، پیپٹائڈیسز اور فاسفوٹرانسفریز قسم کے ٹرانسپورٹرز کی ایک قابل ذکر تعداد پائی جاتی ہے، جو اس کے میزبان یا دیگر آنتوں کے جانداروں پر L. johnsonii NCC533 کے مضبوط انحصار کی تجویز کرتی ہے۔ جینوم کی ترتیب 12 بڑے اور غیر معمولی سطحی پروٹینوں کی بھی پیش گوئی کرتی ہے جو آنتوں کے اپکلا خلیوں سے منسلک ہونے کے لیے اہم ہو سکتے ہیں۔
تین بائل سالٹ ہائیڈرولیس (BSHs) اور دو بائل ایسڈ ٹرانسپورٹرز، جو MDT میں بقا کے لیے اہم سمجھے جاتے ہیں، کا بھی پتہ چلا۔ BSHs کے بارے میں خیال کیا جاتا ہے کہ وہ بیکٹیریل جھلی میں کولیسٹرول یا بائل کو شامل کرنے میں سہولت فراہم کرتے ہیں، α-defensins اور دیگر میزبان دفاعی مالیکیولز کی حساسیت کو متاثر کرنے کے لیے روانی یا چارج کو تبدیل کرتے ہیں۔ pyrimidines dTMP، UMP اور CMP کے ڈی نوو ترکیب کے لیے جین موجود ہیں، لیکن purine biosynthesis کے لیے نہیں۔ انوسین، زانتھائن اور ہائپوکسینتھائن کو IMP، GMP اور AMP میں تبدیل کرنے کے لیے جین موجود ہیں۔ L. johnsonii NCC533 اس لیے بہت سے بلڈنگ بلاکس کے لیے آکسوٹروفک ہے، اس کی غذائی ضروریات کے مطابق۔ خارجی امینو ایسڈز پر مکمل انحصار غیر معمولی طور پر بڑی تعداد اور پروٹینیسز، پیپٹائڈ ٹرانسپورٹرز اور پیپٹائڈیسز (> 25 cytoplasmic peptidases) کے تنوع کے ساتھ ہوتا ہے۔
مجموعی طور پر، L. johnsonii NCC533 Bifidobacteria، Bacteroides اور دیگر کالونی بیکٹیریا کے مقابلے میں اوپری MDT کے ماحول میں بہتر طور پر موافق نظر آتا ہے۔ تاہم، یہ طے کرنا باقی ہے کہ آیا L. johnsonii MDT کا "لازمی" کامنسل ہے یا اس کے دیگر ذخائر ہیں۔ L. johnsonii کا جینوم بڑی حد تک اس کے قریبی رشتہ دار L. gasseri سے ملتا جلتا ہے۔ بیسل میٹابولزم جینز>94% ترتیب کی شناخت ظاہر کرتے ہیں۔ مکمل جینوم کی ترتیب میزبان 'انسان' کے ساتھ کامنسل تعاملات کی بہتر تفہیم کی بنیاد فراہم کرتی ہے۔
ماخذ: کولمبچ [KRÖCKEL]
