Detekcija salmonele u hrani pomoću genskih sondi
“Zlatni standard” za otkrivanje salmonele u hrani, koji se temelji na konvencionalnoj kulturološkoj metodologiji, zahtijeva mnogo vremena i rada. Potrebno je 3 do 5 radnih dana da rezultati budu dostupni. Stoga postoji veliki interes za razvoj brzih, osjetljivih i specifičnih metoda detekcije. U prethodnim studijama opisana je tehnika u kojoj je podjedinica ribosoma 23S Salmonella detektirana u tkivima in situ hibridizacijom korištenjem fluorescentno obilježenih genskih sondi.
FANG i sur. provjerili u kojoj je mjeri ova FISH (fluorescentna in situ hibridizacija) metoda prikladna za otkrivanje salmonele u hrani (Q. FANG, S. BROCKMANN, K. BOTZENHART, A. WIEDEMANN: Poboljšano otkrivanje Salmonella spp. u hrani fluorescentnim u situ hibridizacija s 23S rRNA probama: usporedba s konvencionalnim metodama kulture).
Za svoje studije, autori su koristili tri oligonukleotidne sonde (Sal-1, Sal-3, Sal-544) koje su bile specifične za 23S rRNA Salmonella. Ovim je probama testiran ukupno 51 soj Salmonella različitih serovara i 46 sojeva drugih vrsta Enterobacteriaceae i vrsta drugih familija. Svi sojevi Salmonella hibridizirali su se sa sondama; nije primijećena unakrsna reakcija s drugim izolatima koji ne pripadaju vrsti Salmonella. Nadalje, ispitano je može li drugačije pohranjivanje testnih sojeva prije provođenja FISH metode utjecati na rezultate. Nije uočen utjecaj uvjeta skladištenja ispitivanih sojeva na učinkovitost.
Ispitivanje 18 različitih vrsta hrane pokazalo je da različite matrice također nisu utjecale na rezultate testa. FISH metodom salmonela je utvrđena u 52 (sonda Sal-1), 56 (sonda Sal-3) i 36 od 225 nativnih uzoraka. Koristeći standardne konvencionalne metode kulture, salmonela je izolirana iz samo 30 od 225 uzoraka.
Izvor: Pichner [ PICHNER ]
